Amy Lynn Lee, 13 Aralık 1981 tarihinde Riverside, California'daki Parkview Hastanesi'nde doğdu. Bir erkek(Robby) ve iki kız kardeşi(Carrie, Lori) var. Amy Lee henüz 6 yaşındayken, 3 yaşındaki kız kardeşi Bonnie hayatını kaybetti. Amy, okuldayken koronun başkanıydı ve birkaç oyunda sahne almıştı. Ailesi Illinois, Kansas ve Florida dahil birçok yere taşındı. Fakat son olarak Little Rock, Arkansas'a, yani Evanescence'nin kurulduğu yere, taşındılar. 2000 yılında Pulaski Academy'den mezun oldu. Ayrıca Middle Tennessee State University'ine de katıldı.
Daha sonradan Amy Lee, ölen kardeşi için Fallen albümünde yer alan "Hello" yu yazdı. Bu şarkı aynı zamanda grubun canlı performanslarında söylemedikleri tek Fallen şarkısı.
Gençliğinde 9 yıl piyano eğitimi aldı. 1994 yılında bir yaz kampında piyano ile Meat Loaf'ın "I'd Do Anything for Love (But I Won't Do That)" şarkısını çalarken Ben Moody ile tanıştı. Moody ona beraber grup kurmayı teklif etti. Daha sonra Childish Intentions ve Stricken gibi bir kaç isim kullandıktan sonra Evanescence'yi kurdular.
2003 yılının Mayıs ayından beri Seether grubunun solisti Shaun Morgan ile bir ilişkileri vardı, fakat ikili 2005 yılının ikinci yarısında ayrıldılar.